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模拟的医疗记录数据集,演示字符串检测和位置查找

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下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容(原文8251字)。

一、字符串检测和位置查找

3、统计匹配模式的数量

str_count()函数可以用来统计匹配模式在每个字符串中出现的次数。例如:

str_count(country, "an")

输出结果为:

[1] 0 1 1 0

这里“American”和“Japan”中各有1个“an”,而其他字符串中没有。

 4、应用例子

下面我们将使用一个模拟的医疗记录数据集,其中包含各种病历记录,我们将用这些函数来查找和统计记录中包含特定症状或疾病的条目。

library(stringr)  # 加载stringr包,以便使用字符串处理函数

# 示例医疗记录数据,包含多个病人的症状描述
records <- c("Patient 1: Diagnosed with type 2 diabetes and diabetes complications.",
             "Patient 2: No history of diabetes, but has high cholesterol.",
             "Patient 3: Type 1 diabetes and diabetes management issues.",
             "Patient 4: History of asthma and seasonal allergies.",
             "Patient 5: Diabetes management plan reviewed in last visit, diabetes treatment was updated.")

# 使用str_which()函数找出包含“diabetes”这一模式的记录的索引
# str_which()返回的是符合条件的记录的索引位置
indices_with_diabetes <- str_which(records, "diabetes")

# 使用str_count()函数计算每条记录中“diabetes”出现的次数
# str_count()返回的是一个向量,其中每个元素表示对应记录中“diabetes”的出现次数
count_diabetes <- str_count(records, "diabetes")

# 根据之前得到的索引提取包含“diabetes”的记录
# records_with_diabetes中包含了所有包含“diabetes”的记录
records_with_diabetes <- records[indices_with_diabetes]

# 使用索引提取“diabetes”出现次数
# counts_in_records中包含了对应记录中“diabetes”的出现次数
counts_in_records <- count_diabetes[indices_with_diabetes]

# 打印结果:遍历每条包含“diabetes”的记录,并显示记录的索引、内容以及“diabetes”的出现次数
for (i in seq_along(records_with_diabetes)) {
  # 使用sprintf()格式化字符串,将记录的索引、内容和出现次数插入到打印的文本中
  cat(sprintf("Record %d: \"%s\" contains 'diabetes' %d time(s).\n",
              indices_with_diabetes[i], records_with_diabetes[i], counts_in_records[i]))
}

结果为:

Record 1: "Patient 1: Diagnosed with type 2 diabetes and diabetes complications." contains 'diabetes' 2 time(s).
Record 2: "Patient 2: No history of diabetes, but has high cholesterol." contains 'diabetes' 1 time(s).
Record 3: "Patient 3: Type 1 diabetes and diabetes management issues." contains 'diabetes' 2 time(s).
Record 5: "Patient 5: Diabetes management plan reviewed in last visit, diabetes treatment was updated." contains 'diabetes' 1 time(s).

 

 市面上的 R 语言培训班和书籍(包括网络上的文章或视频),由于受限于培训时间或书籍篇幅,往往难以深入探讨 R 语言在数据科学或人工智能中的具体应用场景,内容泛泛而谈,最终无法真正解决实际工作中的问题。同时,它们也缺乏针对医药领域的深度结合与讨论。为了解决这些痛点,我们推出了《用 R 探索医药数据科学》专栏。该专栏将持续更新,不仅为您提供系统化的学习内容,更致力于成为您掌握最新、最全医药数据科学技术的得力助手。

  •  每篇文章篇幅在5000字 至9000字之间。
  • 内容涵盖试验统计、预测模型、科研绘图、数据库、机器学习等热点领域。

《用 R 探索医药数据科学》专栏目录(截止11月份19日)

第一章:认识数据科学和R

第二章:R的安装和数据读取

第三章:认识数据

第四章:数据的预处理

第五章:定量数据的统计描述

第六章:定性数据的统计描述 

第七章:R的传统绘图

 

第八章:R的进阶绘图

 

第九章:临床试验的统计 

第十章:Meta分析攻略

​​

第十一章:主成分分析

  

第十二章:常见类型回归分析

第十三章:生存分析模型

第十四章:匹配技术应用

第十五章:判别和聚类分析

第十六章:机器学习入门 

第十七章:文献计量学 

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