商标在申请中是可以办理转让的，但是需要向有关部门提交申请书和相关材料。根据法律规定，转让注册商标的，转让人和受让人应当签订转让协议，并向商标局提交转让注册商标申请书。转让注册商标申请手续应当由转让人和受让人共同办理。商标局核准转让注册商标申请的，发给受让人相应证明，并予以公告。转让注册商标，商标注册人对其在同一种或者类似商品上注册的相同或者近似的商标未一并转让的，由商标局通知其限期改正;期满未改正的，视为放弃转让该注册商标的申请，商标局应当书面通知申请人。
法律依据
《中华人民共和国商标法实施条例》第三十一条
《中华人民共和国商标法》第四十二条
