医疗纠纷处理程序是：
1、双方当事人可以采用协商的方式处理，经协商达成一致的，应当签署书面和解协议书；
2、当事人也可以申请人民调解或者行政调解；
3、协商、调解不成的，可以依法向人民提起诉讼。
当事人也可以直接向人民提起诉讼。
【法律依据】
《医疗纠纷预防和处理条例》第二十二条
发生医疗纠纷，医患双方可以通过下列途径解决：
（一）双方自愿协商；
（二）申请人民调解；
（三）申请行政调解；
（四）向人民提起诉讼；
（五）法律、法规规定的其他途径。
第四十三条
发生医疗纠纷，当事人协商、调解不成的，可以依法向人民提起诉讼。当事人也可以直接向人民提起诉讼。
