法律分析：1、性质不同：二者之间由于被处理对象的错误和问题的性质不同，有一定区别。开除党籍是党内的最高纪律处分，适用于严重违反党的纪律，丧失党员条件的表现。清除出党通常是对那些混入党内的叛徒、特务、反分子、党内分子等所采取的一种组织措施。2、惩罚的后果不同：犯了严重错误被开除党籍的人，经过长期考验，已经改正错误，本人提出重新入党申请，经党组织严格审查，对符合党员条件的，五年后可以重新入党。而被清除出党的人，不得再重新入党。
法律依据：《中国党章程》第九条 党员有的自由。党员要求，应当经支部大会讨论后宣布除名，并报上级党组织备案。党员缺乏意志，不履行党员义务，不符合党员条件，党的支部应当对他进行教育，要求他限期改正；经教育仍无转变的，应当劝他。劝党员，应当经支部大会讨论决定，并报上级党组织批准。如被劝告的党员坚持不退，应当提交支部大会讨论，决定把他除名，并报上级党组织批准。党员如果没有正当理由，连续六个月不参加党的组织生活，或不交纳党费，或不做党所分配的工作，就被认为是自行脱党。支部大会应当决定把这样的党员除名，并报上级党组织批准。
