法律分析：
员工自动离职，是指没有申请辞职的情况下没有到单位上班旷工被单位辞退。单位是可以以此扣除员工奖励性待遇，但是工资部分是不能扣除的，如果员工行为造成公司直接经济损失，可以扣员工工资部分抵扣损失。所以到底扣多少是需要根据工作结构以及是否存在损失计算的。
法律依据：
《中华人民共和国工资支付暂行条例》 第十六条 因劳动者本人原因给用人单位造成经济损失的，用人单位可按照劳动合同的约定要求其赔偿经济损失。经济损失的赔偿，可从劳动者本人的工资中扣除。但每月扣除的部分不得超过劳动者当月工资的20%。若扣除后的剩余工资部分低于当地月最低工资标准，则按最低工资标准支付。
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