基本农田可以种果树的补偿依据

果树征收补偿一般按照文件以及当年的果树市场进行估价，当年的按照苗木价，多年的则按照直径、高度、宽度进行估价。但是各地区的青苗补偿标准都不一样，每亩多于规定棵数的按标准计补，少于规定棵数的则按每棵树对应的单价和实际清点棵数计补。
1、可以采用果树主干的横断面面积来计算果树产量，再根据果品的单价来计算年产值。年产值的3倍即为果树的价值，如果全园树体大小不一，则随机采样（20株以上）来计算横截面积。用皮尺测量出树干（距离地面20厘米左右）的周长，然后根据周长计算出横截面积（用平方厘米表示）。在果树价值评估时经常采用此方法。
2、另一种方法是按照幼苗期、初结果期、盛果期等果树生长周期，每株按照一定价格大体赔偿的（具体赔偿标准根据树种和省份而定）。不论采用何种方法赔偿，都要经过当地果树主管部门的评估或鉴定，一般由或征地部门委托鉴定才会生效。
人民受理公民、法人或者其他组织提起的下列诉讼：
1、对行政拘留、暂扣或者吊销许可证和执照、责令停产停业、没收违法所得、没收非法财物、罚款、警告等行政处罚不服的；
2、对人身自由或者对财产的查封、扣押、冻结等行政强制措施和行政强制执行不服的；
3、申请行政许可，行政机关拒绝或者在法定期限内不予答复，或者对行政机关作出的有关行政许可的其他决定不服的；
4、对行政机关作出的关于确认土地、矿藏、水流、森林、山岭、草原、荒地、滩涂、海域等自然资源的所有权或者使用权的决定不服的；
5、对征收、征用决定及其补偿决定不服的；
6、申请行政机关履行保护人身权、财产权等合法权益的法定职责，行政机关拒绝履行或者不予答复的；
7、认为行政机关侵犯其经营自主权或者农村土地承包经营权、农村土地经营权的；
8、认为行政机关滥用行政权力排除或者竞争的；
9、认为行政机关违法集资、摊派费用或者违法要求履行其他义务的；
10、认为行政机关没有依法支付抚恤金、最低生活保障待遇或者社会保险待遇的；
11、认为行政机关不依法履行、未按照约定履行或者违法变更、解除特许经营协议、土地房屋征收补偿协议等协议的；
12、认为行政机关侵犯其他人身权、财产权等合法权益的。
综上所述，基本农田种有果树被征收之后应当给予赔偿。对于征收农业用地的赔偿。具体标准按照所在地的财务收入情况决定，同时也要对该农田的基本情况进行评估，评估之后按照实际情况给予赔偿。
【法律依据】：
《中华人民共和国土地管理法》第三十三条
国家实行永久基本农田保护制度。下列耕地应当根据土地利用总体规划划为永久基本农田，实行严格保护：
（一）经农业农村主管部门或者县级以上地方批准确定的粮、棉、油、糖等重要农产品生产基地内的耕地；
（二）有良好的水利与水土保持设施的耕地，正在实施改造计划以及可以改造的中、低产田和已建成的高标准农田；
（三）蔬菜生产基地；
（四）农业科研、教学试验田；
（五）规定应当划为永久基本农田的其他耕地。
各省、自治区、直辖市划定的永久基本农田一般应当占本行政区域内耕地的百分之八十以上，具体比例由根据各省、自治区、直辖市耕地实际情况规定。