不起诉机关会怎么处理

不予起诉的案件，机关应当改变强制措施，或者进行补充侦查，机关认为不起诉的决定有错误的时候，可以要求复议，如果意见不被接受，可以向上一级人民提请复核。
不起诉还追究么
不起诉不会追究。人民作出不起诉的决定，应当公开宣布，并且将不起诉决定书送达被不起诉人和他的所在单位。如果被不起诉人在押，应当立即释放。可见，机关是不会再将不起诉人拘捕的。决定不起诉的，应对在押的被不起诉人立即予以释放，即机关对本案的被不起诉人一般也不会再追究刑事责任呢；但如果决定不起诉的是机关移送起诉的案件，当机关认为该决定有误的，可以要求复议或向上级提请复核。
人民作出不起诉决定，应当公开宣布，如果被不起诉人在押，应当立即释放。可见，机关是不会再将不起诉人拘捕的。一般情况下做出了不起诉决定，这个案子就算结了。但是机关可以申请复核，另外如果有其他新的证据，也可以重新移送起诉。决定不起诉，表明行为人不构成犯罪，司法机关不再追究其刑事责任，除非之后有新的证据证明其构成犯罪；决定不起诉，并不是代表完全不用承担其他责任，如果涉嫌行政违法，还要承担行政责任，如果造成他人损失等，还要承担民事赔偿相关责任。不予起诉的案件，机关应当改变强制措施，或者进行补充侦查，机关认为不起诉的决定有错误的时候，可以要求复议，如果意见不被接受，可以向上一级人民提请复核。
综上所述、不予起诉的案件，机关应当改变强制措施，或者进行补充侦查，机关认为不起诉的决定有错误的时候，可以要求复议，如果意见不被接受，可以向上一级人民提请复核。
【法律依据】：
《中华人民共和国刑事诉讼法》第一百七十九条
对于机关移送起诉的案件，人民决定不起诉的，应当将不起诉决定书送达机关。机关认为不起诉的决定有错误的时候，可以要求复议，如果意见不被接受，可以向上一级人民提请复核。