在确定公司究竟是否有权扣除员工工资时，需要根据实际情况进行具体分析。
通常来讲，若是扣除底薪没有任何法律或合理依据，那么这种行为便是违法的。
例如，当劳动合同中已明确规定了底薪数额及发放条件，而公司却无视员工的权益擅自削减，这种做法便违反了合同内容。
同样，即使员工个人原因导致了轻微经济损失，公司也不可对其进行过多的扣薪处理。
然而，若员工出现诸如严重违反而给公司带来巨额损失这样的情况，那么公司依法根据已公示的规章制度进行适当扣薪或许就没有违法之嫌了。
总的来说，是否违法关键在于公司是否具备合适的扣薪理由以及是否遵守了正当程序。
