1、来源：有机肥是指来源于动植物或农业废弃物等有机物质的肥料，包括饲料、秸秆、粪便、骨骼、藻类等。复合肥是指经过化学合成或混合而成的复合肥料，包括氮、磷、钾等单一营养素和微量元素。
2、成分：有机肥的成分主要是有机物质，含有丰富的有机质、氮、磷、钾等营养元素，所含有机质量较高，但营养元素含量不稳定，品质也参差不齐；复合肥则是将多种营养元素混合制成的肥料，所含营养元素比较稳定，而有机质含量偏低。
3、营养素含量：有机肥的营养素含量比较低，一般钾、磷含量较低，会产生随机变异，而复合肥的营养素含量比较稳定，各种元素含量可以自由控制，以满足不同作物对营养元素的需求。
4、施用效果：有机肥不但可以为植物提供营养，而且还可以改善土壤质量和土壤结构，减少土壤酸碱度，提高土壤保水能力。而复合肥更注重针对不同作物及其需求，通过选择合适的配比和施用方法，达到提高作物产量和品质的效果。
